在隔离期间被隔离人员的工资报酬由其所在单位支付。在隔离期间应当视为正常工作期间正常的发放工资。因为我国《传染病防治法》规定，被隔离人员有工作单位的，所在单位不能停止支付员工在被隔离期间的工作报酬。
《传染病防治法》第四十一条，对已经发生甲类传染病病例的场所或者该场所内的特定区域的人员，所在地的县级以上地方人民政府可以实施隔离措施，并同时向上一级人民政府报告；接到报告的上级人民政府应当即时作出是否批准的决定。上级人民政府作出不予批准决定的，实施隔离措施的人民政府应当立即解除隔离措施。
在隔离期间，实施隔离措施的人民政府应当对被隔离人员提供生活保障；被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。
隔离措施的解除，由原决定机关决定并宣布。
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