两者的补偿对象不同。青苗补偿费是对已栽种未收获的农产品的补偿，而地上附着物是对于农地里搭建的如大棚、灌溉系统等的补偿。
《土地管理法》第二十七条，国家建设征用土地，由用地单位支付土地补偿费。征用耕地的补偿费，为该耕地被征用前三年平均年产值的三至六倍。征用其他土地的补偿费标准，由省、自治区、直辖市参照征用耕地的补偿费标准规定。
被征用土地上的附着物和青苗的补偿标准，由省、自治区、直辖市规定。
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