有工资。在员工不辞而别的情况下，劳动者已提供劳动部分对应报酬不应被剥夺，应当按照劳动合同发工资。但是员工无故自离很有可能没有对工作进行交接、办理离职手续，有可能违法合同约定，给公司造成损失的，需要承担赔偿责任。
《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
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