公司用滞销品抵扣工资不合法。法律规定，工资应当以法定货币支付，而不能以实物及有价证券替代货币支付。所以显然以滞销商品抵扣工资的做法是不合法的。
如果公司这么做劳动者是可以申请劳动仲裁，要求单位以货币的形式支付工资的。
《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
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