1、分公司与总公司之间不涉及合并的问题，合并行为至少得两个公司才行，分公司不具有独立的主体资格，它只是总公司的一个分支（其财产实际为总公司所有）。
2、您可以先将分公司注销。先由总公司做出分公司撤销的决议，总公司应当自决议作出之日起30日内向该分公司的公司登记机关申请注销登记。申请注销登记应当提交总公司法定代表人签署的注销登记申请书和分公司的《营业执照》。
根据《公司法》第172条规定：公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。 一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散。
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