市区限速40开60不扣分。但如果机动车驾驶人在市区限速40的情况下,超过规定时速百分之五十的,应当由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款,可以并处吊销机动车驾驶证。
《道路交通安全法》第四十二条,机动车上道路行驶,不得超过限速标志标明的最高时速。在没有限速标志的路段,应当保持安全车速。夜间行驶或者在容易发生危险的路段行驶,以及遇有沙尘、冰雹、雨、雪、雾、结冰等气象条件时,应当降低行驶速度。