由于查封、扣押、冻结的主体不同，人民法院判决后在案财物的处理程序也不相同。
1、人民法院受理案件时，对于侦查机关冻结在金融机构的存款、汇款、债券、股票、基金份额等赃款赃物，应当审查是否附有金融机构出具的证明文 件原件。人民法院作出生效判决后，通知该金融机构上缴国库，伺时将判决书 送达有关财政机关。金融机构应当在接到执行通知书后规定期限内向人民法院送交执行回单。
2、对于查封、扣押、冻结的赃款赃物依法不移送的，人民法院作出的判决生效后，由原审的人民法院通知查封、扣押、冻结机关上缴国库，同时将通 知及判决书送达有关财政机关。查封、扣押、冻结机关应当在接到执行通知书后规定期限内向人民法院送交执行回单。
3、对于人民法院查封、扣押、冻结的赃款赃物及其孳息，人民法院作出的判决生效后，由原审人民法院依照生效的法律文书进行处理。除依法返还被 害人的以外，应当一律没收，上缴国库。法律另有规定的除外。
4、对于应当返还被害人的扣押、冻结款物，无人认领的，应当公告通知。公告满一年无人认领的，依法上缴国库无人认领的款物在上缴国库后有人认领，经查证 属实的，人民检察院应当向政府财政部门申请退库或者返还。原物已经拍卖、变卖的，应当退回价款。
《刑法》第六十四条，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔;对被害人的合法财产，应当及时返还;违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
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