农村土地使用权证变更的办理流程为：
1、申请。
(1)由农村村民个人向所属乡镇国土资源管理所提出申请，领取土地登记申请审批表；
(2)提交个人身份证或农村居民户口簿复印件一份；
(3)土地权属材料。
2、调查，由乡镇国土资源管理所对申请者的用地进行地籍调查、地籍测量、申请人现场指界、邻宗地签字盖章，填写地籍调查表，绘制宗地草图。
3、审核，先由乡镇国土资源管理所进行审核，再报县国土资源局审核，审核用地材料是否合法，用地界线是否无争议，用地面积是否准确。
4、审批，经审核符合“用地面积清楚，界址准确，权属合法，无争议”原则的，可批准并进行张榜公布，在公布一个月内无单位或个人对其提出争议的，由县人民政府颁发集体土地使用证。
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