有外遇离婚的，对于孩子抚养权的归属并没有很大的影响。如果双方可以自行协商孩子由谁扶养的，则双方自行协商即可；如果无法协商的，则可以由法院判决。
法院一般会判决两周岁以下的孩子由女方抚养，两周岁以上的孩子，综合考虑双方的经济收入、住宿、教育环境、生活环境、孩子的年龄等因素，按照按照最有利于未成年子女的原则判决抚养权到底归哪一方。
需要注意的是，如果孩子在两周岁以下，但女方有下列情况的，抚养权会判给男方：
（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；
（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；
（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。
《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
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