签订征地补偿协议的程序是：
1、发布拟征地通告；
2、征询村民意见，组织听证；
3、地籍调查和地上附着物登记确认；
4、拟定“一书四方案”并上报审批；
5、征用土地公告；
6、征地补偿登记；
7、拟定补偿安置方案并公告；
8、根据群众意见修改相关方案并公告；
9、签订征地补偿协议，落实征地补偿、安置资金。
征地协议的生效要件主要包括：
1、签订协议的当事人具有相应的行为能力；
2、补偿方式、补偿金额和支付期限等重要条款的规定合法合理；
3、协议是当事人真实的意思表示等要件。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十五条，房屋征收部门应当对房屋征收范围内房屋的权属、区位、用途、建筑面积等情况组织调查登记，被征收人应当予以配合。调查结果应当在房屋征收范围内向被征收人公布。
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