根据法律规定作为地上部分的房屋与作为地下部分的地下室都有成为物权客体的资格，可以对他们单独行使权利而不涉及对方，购房款包不包括地下室要看购房合同是否约定。
出现矛盾及解决办法：
(一)逾期交付房屋纠纷：只要不构成不可抗力，卖方就应当承担责任。
(二)权属证书缺失引发的纠纷：买方者可以要求解除合同。
(三)一房二卖纠纷：该当事人有权解除合同。
(四)房屋质量纠纷：买房人有解除合同的权利。
(五)房屋面积误差纠纷：产权登记面积与合同约定面积误差比绝对值超出3%的，买受人享有解除权。
根据《物权法》第一百三十六条规定，建设用地使用权可以在土地的地表、地上或者地下分别设立。
新设立的建设用地使用权，不得损害已设立的用益物权。
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