法院拍卖土地使用证的注意事项有：
1.进行及时有效的查封，应当向有关管理机关发出协助执行通知书，要求其不得办理查封财产的转移过户手续；
2.进行合法的评估，应当委托依法成立的资产评估机构进行价格评估；
3.进行公正的拍卖，只有符合法定条件的拍卖企业，才有资格成为受托对象；
4.进行有效的转移，拍卖成交后，执行法院应及时将拍卖标的物转移给买受人。
根据《土地管理法实施条例》第三条，国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
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