企业克扣工资，员工可以选择以下方式进行投诉：
1、打劳动保障热经12333投诉，投诉时需要实名投诉，提供本人的身份证号码、姓名。
2、到当地劳动站、人力资源和社会保障局的劳动监察大队投诉，由劳动监察部门责令限期支付工资报酬，企业逾期不支付的，责令按照应付金额50%以上1倍以下的标准向员工加付赔偿金。
3、去辖区人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令，要求企业按照劳动合同约定和国家规定，向员工及时足额支付工资报酬。
《劳动保障监察条例》第二十六条
用人单位有下列行为之一的，由劳动保障行政部门分别责令限期支付劳动者的工资报酬、劳动者工资低于当地最低工资标准的差额或者解除劳动合同的经济补偿；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50%以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的；
（二）支付劳动者的工资低于当地最低工资标准的；
（三）解除劳动合同未依法给予劳动者经济补偿的。
《劳动合同法》第三十条
用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
《劳动法》第五十条
工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
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