分居三年的，如果双方是因感情不和而分居的，而且是连续分居三年的，那法院会判决离婚。
依据我国法律规定，双方感情破裂，可以直接办理离婚手续，如果双方对财产分割、子女抚养等达不成一致意见的，可起诉到法院离婚。对于分居多久才可以离婚，法律是没有规定，不论分居多长时间，如果双方都不提出离婚，婚姻不会自动解除的。如果起诉到法院离婚，分居满2年，法院会支持离婚。
分居能证明夫妻感情破裂的情形有：
1、指因夫妻感情不和，双方分开居住，且互不履行夫妻之间的义务。
2、分居必须是连续的，且已满两年。
3、夫妻分居的实质是互不履行夫妻性生活之义务。
4、夫妻分居满两年”须以证据证明，证明包括：
（1）一方在外居住的房屋租赁合同；
（2）双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；
（3）一方向另一方发出的书面分居文书，最好是用快件性质邮寄，在备注栏里注明“分居”，并且保留邮寄凭证，从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间；
（4）双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实；
（5）人证也可以，比如双方都认识的朋友或者亲戚，不过因为证人往往和为其作证的一方有利害关系及分居是夫妻“私事”，所以单独的证人证言难为法院采信，要辅佐以其他的证据。
《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
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