员工代公司签合同违约的处理方式：
1、如果公司对该合同进行了追认，或者员工代签合同的行为构成表见代理的，则该合同有效，员工违约后，由公司承担相应责任，公司可以向员工追偿。
2、如果公司拒绝追认，并且员工代签合同的行为也不属于表见代理的，则该合同对公司不发生效力，相应法律后果由员工承担。
《中华人民共和国民法典》第一百七十二条行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，相对人有理由相信行为人有代理权的，代理行为有效。
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