施工合同三年后还可以起诉。诉权是合同当事人的法定权利，并不会因为诉讼时效届满而消失，但是当事人在诉讼时效届满后起诉的，被起诉方可以进行诉讼时效抗辩，起诉方的主张不会得到法院的支持。
《民事诉讼法》第一百二十二条
起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
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