法院认定协议是否有效的方式为审查订立协议的当事人是否具有相应的民事行为能力、协议当事人的意思表示是否真实、协议的订立过程是否存在欺诈及胁迫等情形、协议内容是否违反法律、是否违背公序良俗等。
《中华人民共和国民法典》第一百四十三条具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
《中华人民共和国民法典》第一百五十六条民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。
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