员工开公司车在执行职务中违章罚款应由公司承担,员工故意或者重大过失导致违章的,员工应与公司共同承担罚款,员工私用公车的,应由员工自行承担罚款。
《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的,由用人单位承担侵权责任。用人单位承担侵权责任后,可以向有故意或者重大过失的工作人员追偿。劳务派遣期间,被派遣的工作人员因执行工作任务造成他人损害的,由接受劳务派遣的用工单位承担侵权责任;劳务派遣单位有过错的,承担相应的责任。