农村租赁土地，协议中写明了允许建房，是耕地，条款无效。因为农用地被私下改为建设用地，违反《土地管理法》，而任何违反法律的合同条款，都是无效的。
《土地管理法》第一条
为了加强土地管理，维护土地的社会主义公有制，保护、开发土地资源，合理利用土地，切实保护耕地，促进社会经济的可持续发展，根据宪法，制定本法。
第三十七条
非农业建设必须节约使用土地，可以利用荒地的，不得占用耕地；可以利用劣地的，不得占用好地。
禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。
禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼。
温馨提示：
