薄囊蕨亚纲是真蕨纲的一个亚纲，孢子囊壁仅由一层细胞组成。内含：紫箕目，又称薇目，出现于石炭纪；真蕨目，出现于石炭纪，至现代仍有；复目，和槐叶复目均出现于第三纪，延续到今天。
薄囊蕨亚纲是真蕨纲的一个亚纲，孢子囊壁仅由一层细胞组成。内含：紫箕目，又称薇目，出现于石炭纪；真蕨目，出现于石炭纪，至现代仍有；复目，和槐叶复目均出现于第三纪，延续到今天。
孢子囊起源于一个表层细胞，它的壁仅由一层细胞组成。孢子同型或异型。精子器突出于原叶体表面之上。幼胚无胚柄。
本亚纲是蕨纲中占绝对优势的一大羣植物。通常见到的蕨类植物，如蕨菜，铁芒萁等都是属于本亚纲的植物。可分为如下三目。
真蕨目 Eufilicales
苹目 Marsileales
槐叶苹目 Salviniales
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