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star活性

发布时间:2023-09-14 18:28:56

限制酶在一些特定条件下使用时,对于底物DNA的特异性可能降低。即可以把与原来识别的特定的DNA序列不同的碱基序列切断,这个现象叫Star活性。Star活性出现的频率,根据酶、底物DNA、反应条件的不同而不同。

star活性介绍

限制酶在一些特定条件下使用时,对于底物DNA的特异性可能降低。即可以把与原来识别的特定的DNA序列不同的碱基序列切断,这个现象叫Star活性。Star活性出现的频率,根据酶、底物DNA、反应条件的不同而不同。

star活性

star活性出现因素

导致Star活性出现的因素包括:低粒子强度、高pH值以及过高的甘油浓度(> 5% v/v)。尤其是最后一点,因为一般限制酶生产商提供的缓冲液(buffer)都含有较高的甘油浓度(典型为50% v/v),如果稀释不充分就有可能导致Star活性的出现。当有一个以上酶切位点时,该问题显得更加突出。

star活性引起原因

1. 较高的甘油浓度 (>5% v/v)。

2. 酶与底物DNA比例过高 (不同的酶情况不同,通常为>100 U/μg)。

3. 低盐浓度 (<25 mM)。

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4. 高pH值 (pH>8.0)。

5. 存在有机溶剂 (如DMSO、乙醇、乙烯乙二醇、二甲基乙酰胺、二甲基甲酰胺等)。

6. 用其他二价离子替代镁离子 (如Mn,Cu,Co,Zn等)。 Star活性是内切酶的一种普遍现象,但是大多数可以控制,正常情况下使用提供的缓冲液就不会出现Star活性。

star活性抑制方法

1. 尽量使用较少的酶进行完全消化反应。这样可以避免过度消化以及过高的甘油浓度。

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2. 尽量避免有机溶剂 (如制备DNA时引入的乙醇)的污染。

3. 将离子浓度提高到100~150 mM (若酶活性不受离子强度影响)。

4. 将反应缓冲液的pH值降到7.0。

5. 二价离子使用Mg。

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