丝状菌分布在水生环境、潮湿土壤和活性污泥中,菌丝较长，是一种好氧型细菌。
分类
有铁细菌如：浮游球衣菌（Sphaerotilus natans）、泉发菌属即原铁细菌属（Crenothrix）及纤发菌属（Leptothrix）。丝状硫细菌如：发硫菌属（Thiothrix）、贝日阿托氏菌属（Beggiatoia）、透明颤菌属（Vitreoscilla）、亮发菌属（Luecothrix）等多种丝状菌。
丝状体是丝状菌分类的特征。
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