孢丝是指粘菌纲的某些菌在孢子囊内原生质体中出现在孢子形成分裂之前，其内部从孢囊梗的着生部位已发展成网状，在其腔内由分泌物凝固而形成的菌类。
孢丝粗细不均，有些地方如有较宽阔的管腔，则原生质中的石灰质粒便多集聚在此管腔内而形成石灰节。此外，为了区别从孢子囊外皮与其连接所产生的孢丝样结构，称后者为假孢丝。这些在种、属上均各有其固有的形态，与孢子同为粘菌纲分类上的重要特征。担子菌纲腹菌类子实体的主体中的毛状结构一般虽也称为“孢丝”，但仅是一种菌丝形态，与粘菌纲的孢丝是完全不同的。
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