烟草菌核病又称菌核疫病、颈腐病，是由核盘菌侵染所引起的、发生在烟草上的病害。烟草菌核病在烟草整个生育期均可发生，以成熟期发生最多。病菌也能侵染幼苗茎、叶及蒴果。
烟草菌核病在中国、美国、日本均有发生。在中国长江流域及其以南的烟区发生，以迟栽或晚熟品种以及在多雨高湿年份危害较严重。病菌在中国南方还可以侵染干燥烟叶，引起烤烟霉坏变质。
烟草菌核病的防治方法主要以农业防治和化学防治为主。首先选用抗、耐病品种和早熟品种；实行烟稻轮作，深翻土地，使菌核深埋不能萌发。注意开沟排水，实行高垄栽培，控制种植密度， 以利通风透光。有条件地区可覆盖地膜，以减少病菌传播。施用净肥，清洁田园。最后结合化学药剂进行防治。
病原为核盘菌（Sclerotinia sclerotiorum (Libert) de Bary），属子囊菌亚门核盘菌属。
菌核表面最初白色，后变黄褐色、深褐色甚至黑色，内部灰白色，球形、椭园形至不规则形，成熟后较坚硬，大小5-10微米×3-8微米。在一定条件下，菌核萌发产生子囊盘1-7个。子囊盘初淡黄褐色，后暗褐色，喇叭状，直径2-3微米，表面的子实层由无数子囊和夹生在子囊间的侧丝所组成。子囊棍棒状，无色，大小为75-90微米×12.5-15m微米，内含子囊孢子8个。子囊孢子椭圆形，无色，单胞，大小为10.4-14.3微米×3.9-6.5微米，两端各有油球1个侧丝无色，丝状，65-7微米×5-7.5微米。
菌丝生长温度范围为5-31℃，适宜温度15-23℃，致死温度为44℃、10分钟。菌核萌发产生菌丝的温度范围为10-31℃，适宜温度15-29℃，致死温度为50℃、10分钟。病菌生长相对湿度范围75.5-100%，适宜相对湿度85-100%。病菌生长H值范围2-8，适宜pH值5-6.5。光照有无对菌丝生长影响不明显，但对菌核形成则有一定影响，在光照条件下菌核成熟需6天，较黑暗条件下仅需4-5天。子囊形成适宜温度为9-16℃。子囊孢子发芽温度为5-30℃，与菌丝生长温度相似。
该病菌寄主范围很广，在栽培植物中，除烟草外，还可侵染油菜、白菜、芥菜、甘蓝花、椰菜、红薯、马铃薯、茄、番茄、辣椒、莴苣、黄瓜、大豆、蚕豆、豌豆、菜豆、紫云英、胡萝卜、葱、柑、桔和香蕉等多种植物。
烟草菌核病在烟草整个生育期均可发生，以成熟期发生最多。病菌也能侵染幼苗茎、叶及蒴果。幼苗受侵染，初期在茎部、脚叶及主脉上呈现褐色病变，茎部病斑皮层部凹陷，病叶主脉呈深褐色腐烂，叶上还可形成近圆形黄白色病斑，直径可达6-7毫米，叶片背面病斑可见白色絮状霉层。湿度大时，病斑迅速扩大导致整株幼苗水渍状腐烂。病株上和附近地面可见黑色近圆形或不规则形菌核。大田期受害烟株茎部病斑呈椭圆形，浅褐色，可向上下不规则扩展；病株开始下部叶片凋萎，随着病斑的扩展至全株叶凋萎。发病后期茎部病斑皮层常凹陷消失，髓部中空易折断，空茎和受害蒴果内形成许多黑色鼠粪状菌核，摇动时发出沙沙的响声。茎部病斑可沿叶柄基部扩展至叶片形成大片溃疡状病斑，天气潮湿的情况下，在落有带菌花冠的叶片上，随着花冠的腐烂和病菌的侵染，沿花冠周围可形成数厘米大小的枯死斑，形成枯花叶斑症状。此外，还会在晾晒烟及白肋烟调制过程中引起叶片腐烂，称为“仓腐”。
烟草菌核病在中国、美国、日本均有发生。在中国主要分布于广东、广西、贵州、四川、湖北、浙江、安徽、吉林、黑龙江等省（自治区）烟区。
烟草菌核病菌以遗落于土壤中的菌核、残存于烟草及其他寄主植物病株的菌核和菌丝体与混杂于烟草种子中的菌核碎片越冬。次年，若温度、湿度适宜，越冬菌核产生子囊盘、子囊和子囊孢子，子囊孢子随风雨传播，形成初次侵染。此外，残存于烟草及其他寄主植物病组织所长出的菌丝，如与烟株接触，也可直接侵染为害。条件适宜时，病部长出的菌丝和菌核又可形成再侵染。
烟草连作和烟草与其他寄主植物轮作、施用未腐熟带菌堆肥、田间郁蔽高湿、排水不良，病害常较重。在潮湿凉爽的气候条件下发病最快。高湿度有利于病害的发展，也有利于子囊孢子萌发。菌核在潮湿土壤中易于萌发，但存活时间仅1年，在干燥土壤中虽不易萌发，但能存活3年以上；若长期浸水，菌核存活时间则大大缩短。烟草品种不同，病害程度也有定的差异。
发病初期可用40%菌核净可湿性粉剂1500-2000倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液，50%速克灵可湿性粉剂1500-2000倍液，50%多菌灵可湿性粉剂500-800倍液，70%甲基托布津可湿性粉剂100倍液，喷淋烟株茎基部，每隔7-10天1次，连续2-3次。
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