植物检疫方法是由国家颁布法令，制定检疫条例，设立专门机构，对应受检疫的植物及植物产品，实行严格的检疫检验，严禁区域性危险性病、虫和杂草随着植物及其产品调运交流，而输入、输出和传播的行政法治方法。又称法规防治法。植物检疫分对外检疫和对内检疫两种。对外检疫是国家在必要的地点、口岸设立植物检疫检查站，或派驻检疫人员，根据植物检疫法和检疫条例规定，履行对外贸易合同义务，执行检疫检验任务，对进出港的轮船、出入境的飞机、火车所运载货物、包装器材、工具，以及旅客行李、携带果品、蔬菜和食物等，进行严格检疫检验手续，发现附有违禁危险性病、虫和杂草种子，应予以没收，焚烧，或进行熏蒸、消毒处理，并由检疫员签发检疫证书，保护国家信誉。
对内检疫是根据植物检疫法和检疫条例，对国内各省(市)、自治区和地区之间调运植物和植物产品，如种子、苗木及应受检疫的植物及其产品进行检疫检验，防止局部疫区的危险性病、虫和杂草传播扩大为害。对已经发现的要划定疫区和保护区，采取封锁和防治措施。随着我国改革开放政策的实施，国际交往和贸易活动日益增多，国内经济活动频繁，植物检疫倍受重视。正在积极开发新技术在植物检疫检验中的应用，如血清诊断、萤光电镜诊断，以及噬菌体鉴定，X光检验等，以适应日益发展的国际贸易和国民经济建设的需要。
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