指物质代谢过程中从开始物质A到最终产物X的中间各种反应。在反应A→B→C→D→…→X中B→C、C→D等都是中间代谢。中间代谢不是A→X的最短途径，多数是长途径迂回的反应系列。由于细胞内的其他物质或各种条件对中间阶段的酶可产生作用，因此可能调节A的消耗或X的生成速度，同时也能转换成为另外的途径。中间代谢在合成反应时需供给能量，而由异化反应释放出能量（如糖酵解生成ATP）等，所以物质代谢与能量代谢的联系和统一等是很重要的。作为研究手段，可有效地利用示踪物。
中间代谢是机体吸收营养素成分或消化产物以后，所经历的代谢过程的主要内容。它实质上是机体内营养素成分或消化产物在这一代谢阶段所经过的一系列化学反应或生化反应的和。许多中间代谢的反应，需要对应的酶参与。反应的过程也大多包括多重步骤，并在每一步骤中都会产生相对应的代谢中间产物，简称为代谢物。
对于高等动物，包括我们人类，我们知道仅仅只有食物或营养素成分在消化道系统中发生的物理性变化和化学分解，是不能为机体提供能量甚至于机体构成所需要的“原材料”的。营养素的外代谢，只是将营养素成分转化为了可以进一步反应或利用的前提物质，就好象是为中间代谢正常进行所完成的一种准备。
中间代谢也称为细胞内代谢。在中间代谢过程中，机体借助于各种反应从营养素或消化产物中获得能量，以及机体构成所需要的“原材料”。整个中间代谢可以划分为两个过程，即分解代谢和合成代谢，其中分解代谢主要完成获取能量和“原材料”的工作，而合成代谢则主要完成利用贮能和“原材料”构成机体组成成分的任务。
在分解代谢和合成代谢过程中，将包括有一系列的酶催化反应。这种生化酶反应，不仅可以保证机体代谢的正常进行，而且十分有利于反应过程中能量的释放和接受。
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