机构编制管理，是指对一切法定社会组织内部的职能配置、机构设置、组织形式及工作人员的数量、结构等方面的管理。
指机构编制管理机关根据经济社会发展要求，依据法定权限和程序，运用科学的原理、原则和方法，对机关、事业单位的职能配置、机构设置、人员编制及领导职数等进行的管理活动的总称。机构编制管理的主要内容包括：体制管理、职能管理、机构管理、人员编制管理、编制结构管理和领导职数管理。
机构编制管理属行政管理范畴。
狭义上的机构编制管理是指对机关、事业单位及部分企业组织的职能配置、机构设置、人员数额及人员结构的管理。
与一般行政管理的区别
区别于一般行政管理的特点是：
⑴集中程度高。尤其是对国家机关，为了保障其高效和廉价，对其进行集中管理。
⑵综合性强。机构编制管理的范围较宽，涉及到各个机关和单位，要掌握其共同性，又要了解其各自特点，并相应采取不同的管理方法。管理过程须与组织人事工作、财政工作等密切配合、搞好协作。
⑶是一经常性、长期性的工作。只要有管理机关和单位、组织存在，机构编制管理就不能停止。根据工作需要和精简原则科学、合理地配置职能、设置机构和配备人员，是机构编制管理的目标和住所。
机构编制管理与人事管理、财政管理关系尤为密切。在与人事管理方面，编制管理中关于人员数量的确定，要考虑人员来源和现有人员的素质状况，而人事管理中的计划录用、聘用和调配工作，要以人员编制数量为依据，以人员编制数额来制定录用、聘用计划、调配人员，在与财政管理方面，机构的设置和人员编制的确定要考虑到经费来源及财政支付能力；而财政管理中行政和事业经费的开支要以机构的设立为前提，以编制数额为依据。
即必须先有机构和编制才能决定支付经费的方向和数量。一般情况下，由于编制管理的首要依据是工作需要，因而对人事管理和财政管理的影响具有主动性。
机构编制的任务包括：
(1）职能管理。即根据国家在一定时期的方针政策及行政管理的需要，对各政府机构的职能进行配置、调整。其主要任务是：在拟定政府机构改革方案时，提出转变和调整政府职能配置体系的总体意见；在各部门实行“三定”时，合理配置各部门的职能；协调各部门之间的职责分工；协调同级政府部门与下级政府相关部门，以及与企业、事业单位、群众团体和其他国家机关之间的职责分工。
（2）机构管理。即对机构设置与调整的管理，具体包括机构设置的名称、性质、级别、规模·序列、层次、数量等多方面的内容·其中政府机构的名称一般包括域名（表明地理位置或管理范围）、矢名（表明管理内容）和格名（表明规格级别）三项内容，分别说明这些机构的管理范围、隶属关系、管理内容及机构层次。
如某市政府部门名为“某某市民政局”,此处的“某某市”表明了其所处的位置和管理范围，“民政”表明了其管理内容，“局”则表明了其机构的地位。我国政府机构的格名主要有“政府”、“部”、“委员会”、“署”、“行”、“局”、“厅”、“处”、“室”、“科”等。
（3）人员编制管理。即对机构中的人员总额、人员结构、职位配置等方面的管理。
旗帜机构编制系统是一套机构编制信息及编制业务的综合管理系统，该系统不仅可对编制总量进行有效控制，还可实现编制、人员的全程管理，通过该系统有利于进一步强化和规范机构编制管理；有效的解决超编进人、无编进人、汇编混岗的问题，压缩财政供养人员；有效杜绝"吃空饷"情况的发生；为监督、检查提供有力的数据支持。
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