合作金融业务是信用合作组织的经营活动。主要包括： 办理个人储蓄，办理个体经济户、合作经济组织及企事业单位的存款、贷款及结算，代办国家银行及其他单位的存、贷款、证券交易和其他资金收付业务以及经中国人民银行批准的其他业务。
在办理业务时执行中国人民银行统一制定的结算规章制度。大中城市及城镇信用社经当地人民银行批准，可以参加同城票据交换; 县 (市) 联社可以自办辖内的信用社往来结算业务; 县联社与县联社之间，可以开展特约汇兑，县联社可与国家专业银行商定，参加其联行，办理跨地区结算业务。
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