咨询业务的组织机构是指咨询公司按系统职能设置的业务部门。咨询服务的组织形式和隶属关系不同，特点不同，专业各异，规模大小也不一样，其业务组织机构没有固定模式，主要是适应本公司规模、业务范围和管理跨度的不同要求而设置。组织形式是多样化、多层次的，关键是做到合理、健全和完善。一般分为：决策机构、研究开发部门、职能部门、协作单位等。
例如，英国阿特金斯集团所属咨询公司，董事会负责制定公司政策和发展战略，任命各部门负责人，审理公司财务，监督合同签订，检查任务执行情况并定期审定公司的研究报告;下设建筑工程公司、规划公司、合股公司(包括项目管理服务、环境工程等9个办公室)、农业及水源公司、研究及开发公司和国际公司等6个职能公司，还有监督服务、化验、应用技术、开发印刷等5个协作配套公司，构成了它的咨询业务系统;此外，还设有行政和财务管理部门。该公司发展过程中，积极地向世界建筑市场开拓，具有向世界各地的雇主或委托人提供各种咨询服务的充裕能力。
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