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Tajima test

发布时间:2023-09-06 19:23:55

Tajima Test(Tajima’s D)是由日本学者Fumio Tajima在1989年提出的检验模式。该检验的目的是鉴定目标DNA序列在进化过程中是否遵循中性进化模型。

Tajima test

Tajima test详细介绍

Tajima Test(Tajima’s D)是由日本学者Fumio Tajima在1989年提出的检验模式。该检验的目的是鉴定目标DNA序列在进化过程中是否遵循中性进化模型。

进行Tajima检验时,要求提供至少由三条同源序列组成的alignment。Tajima检验将计算并标准化目标序列alignment中每条序列的分离位点数目(number of segregating sites)以及每条序列的核苷酸多样性的值。如果这两个值在统计上被认为差异显著,则拒绝零假设(the null hypothesis),认为目标序列的进化不遵循中性模型,反之,则接受零假设,认为目标序列在进化上遵循中性模型。

Tajima test

实际计算时,Tajima定义了D,作为统计检验量,因此该检验又被称为Tajima’s D。

在实际工作中,可以用软件MEGA 4或DnaSP很方便的进行计算。

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