1、报名要求不同，自考只要身为中华人民共和国公民身份即可，没有前置学历、性别、年龄等方面的限制，而函授是通过成人高考进行招生，报名成人高考低学历为普通高中、中等学校颁发的高中或中专等毕业文凭，可报考高中起点层次，具有国民教育系列专科或专科以上报考专升本层次。
2、考试不同，自考没有入学考试，报名即录取，只有省门组织的专业课程考试，而函授报名者需要参加统一命题、组织的考试，达到当地录取分数线择优录取。
3、学习形式不同，自考主要由学生自主学习、完成课业，而函授平时学生自主学习，寒暑假、节假日等到服务站进行面授学习。
4、学制不同，自考没有学制，也没有学习期限，什么时候学习、考完且成绩合格，什么时候申请毕业，而函授专升本、高起专学制为2.5年，高起本学制为5年，在规定学习期限内完成学业并毕业。
