、开设范围不同。
目前在药学和临床药学在医科院校或者药科大学开设较多，生物制药主要在综合性大学或者药科大学开设。
2、学科等级不同。药学是一个一级学科，生物制药和临床药学都是它的二级学科，也就是这个学科下的分支。
3、所学内容和学制会有所不同，药学学制4年，学的比较多，中西药都要学，但是西医院校偏化学，各种化学，中医院校偏方剂学等；西医院校包括药理药剂药分药化四大药和医学院常规课程比如系解，生理等等以外，也会多开设中药方面的学科，但是只作为了解。临床药学学制5年，学的内容和药学大同小异，但是会要求多1年的医院临床实习；生物制药会偏向微生物和分子生物一些，但是化学也是一直要学的。
4、学位也有一点差异。大多数学校是把药学和临床药学划分到理学，生物制药划分到工学或者理学。毕业以后拿到的是理学或者工学学位而不是医学学位。就业方向：药学以后的就业面向医院，药企，药厂，药店，政府药监部门等；生物制药是生物制药、生化企业和医药管理部门从事技术管理、生产、产品开发工作
