第一阶段：起步期（1998-2004年），以粮食、棉花网上交易为标志。
1998年，郑州商品交易所集诚现货网（现名“中华粮网”）开始进行网上粮食交易；2002年，全国棉花交易市场推出商品棉电子撮合交易，并提供资金、物流配送、信息等配套服务。这一时期，农产品电子商务主要局限于大宗交易，只是现货交易的一种补充。第二阶段：形成期（2005-2011年），以生鲜农产品网上交易为标志。
2009开始，全国涌现了一大批生鲜电商，改写了人们对农产品电商客体的定义和内容，生鲜农产品电商品牌运营一时成为热点。这一时期，农产品电商与人们日常生活之间的距离不断被拉近。
