1、结构不同。
红玉髓实质上是一种隐晶石英，接近与水晶，通透感强；而玉玛瑙属于脱水二氧化硅的胶凝体，透明度低。
2、色泽不同。玉玛瑙有明显的带状条纹，玻璃光泽，色彩变化丰富且有层次。但不如红玉髓的颜色红润；红玉髓颜色比较单一，一般情况也不会出现清晰明显的纹路。因为红玉髓内部结构的分子是非常小的，质地非常细腻。红玉髓透明度高，玉玛瑙透明度低。
3、硬度不同。红玉髓硬度一般在6.5到7之间，而玛瑙硬度一般在7到8之间。
4、价格不同。在体积大小相等，质量条件相似的条件下，同等条件的玉玛瑙价格要比红玉髓要高。
