1.吹奏方式不同。
笛子是需要笛膜才可以吹奏的，而萧的结构则不需要膜，可直接吹奏。
2.音质不同。笛子声音清脆悦耳，高亢嘹亮。萧的声音则相对来说，比较低沉浑厚。
3.长度不同。笛长度一般不超过2尺，萧则多在2尺之上。萧明显比笛子要长很多。
4.演奏方式不同。“横吹笛子，竖吹箫”。
5.构造不同。笛子由一根竹管做成，里面去节中空成内膛，外呈圆柱形，在管身上开有1个吹孔、1个膜孔、6个音孔、2个基音孔和2个助音孔。箫由一根竹管做成，较曲笛长，上端留有竹节，下端和管内去节中空，吹口开在上端边沿，由此处吹气发音。在箫管中部，正面开有五个音孔，背面开有一个音孔。平列在管下端背面的两个圆孔是出音孔，可用来调音。在出音孔下面的两个圆孔为助音孔，它起着美化音色和增大音量的作用，也可用此孔栓系箫穗为装饰。
