主要的区别就是训练飞行的机种不一样。
货机大体可分为民用货机与军用运输机。民用货机方面，比如波音747分为客运型、客货混装型、货机型等不同版本，不同版本间主要区别在于飞机的配平、燃油与航程、空调系统等方面会有所区别外，主要操作介面与检查单方面几乎没有任何差别。飞行员培训飞客运或货运版747时，上手机乎没有任何难度。军用运输机方面，飞行员除了要掌握一般的飞行技巧外，还可能需要接受诸如空中投放、短跑道起降等科目训练。如有必要，可能还会接受空中加油、授油的训练。如果是舰载运输机（像C2），飞行员还需要掌握航母起降的技巧。
