南通市妇幼保健院位于南通市崇川区世纪大道399号，院区总用地面积68786平方米，新建儿童综合大楼位于院区南侧，总建筑面积65380平方米，其中地上51480平方米，地下13900平方米，设计新增床位500床。
新建综合大楼集门急诊、住院、急救中心、挂号收费、儿童保健及康复中心、眼科中心、手术中心、药房、新生儿病房及标准护理单元等医疗功能于一身，极大了提高了本医院的医疗规模。新建儿童综合大楼地上二十一层，地下二层，主楼建筑高度88.0米，裙房建筑高度18.5米及27.3米（建筑高度为室外地坪计算至屋面面层），主楼屋顶女儿墙高度98.2米。
