乡镇卫生院和乡镇事业编制的区别如下：
1. 编制类型不同：乡镇卫生院属于基层医疗系统，理论上乡镇卫生院是差额事业单位编制，乡镇卫生院有自己的收入乡镇事业编制属于全额事业编制，百分之百财政拨款，没有自己的收入2.岗位组成不同：乡镇卫生院属于事业技术岗位，一般都是走职称，需要单位聘用乡镇事业编制有大部分是事业管理岗位，不存在单位聘用这一步，乡镇事业单位还有一部分行政编制的工作人员。
3.工作性质不同：乡镇卫生院是医疗部门，为乡镇，村民进行诊疗活动乡镇事业单位主要属于行政部门，解决乡镇，村门的行政诉求。
