副主任科员晋升主任科员的条件：应当任乡科级副职领导职务或者副主任科员三年以上。
根据《公务员职务任免与职务升降规定（试行）》第二十条 晋升综合管理类非领导职务须具备下列任职年限条件：
1、晋升巡视员职务，应当任厅局级副职领导职务或者副巡视员五年以上；
2、晋升副巡视员职务，应当任县处级正职领导职务或者调研员五年以上；3晋升调研员职务，应当任县处级副职领导职务或者副调研员四年以上；4晋升副调研员职务，应当任乡科级正职领导职务或者主任科员四年以上；5晋升主任科员职务，应当任乡科级副职领导职务或者副主任科员三年以上；6晋升副主任科员职务，应当任科员三年以上；7晋升科员职务，应当任办事员三年以上。
