中国红十字会总会设有6个部室，分别是：办公室：负责总会机关综合协调、机要、文秘、文档、固定资产、后勤事务等工作。
赈济救护部：负责备灾救灾、人道救助、救护培训、社会捐助、志愿服务、救护宣传等工作。筹资与财务部：负责资金筹措、财务管理、会计核算、项目执行监督等工作。组织宣传部：负责组织建设、社区发展、宣传传播、文化活动等工作。联络部：负责国际及港澳台地区红十字事务交流与合作。机关党委（人事部）：负责党务工作、党风廉政建设、干部队伍建设、离退休干部服务等工作。
此外，根据2020年1月官网信息显示，中国红十字会还有9个直属单位，分别是：中国红十字会总会训练中心中国红十字会总会事业发展中心中国红十字会总会对外联络中心中国红十字会总会救援中心中国红十字会总会台湾事务办公室中国红十字会总会赈济救护部综合事务办公室北京物资学院中国红十字会备灾救灾与应急管理研究中心北京物资学院中国红十字会救护总队应急救护培训基地中国红十字会总会报刊图书编辑中心
