天然水晶的晶体是相对稳定的结晶状，通常情况下，天然水晶不存在褪色甚至变色的可能。
在某些特殊的条件下不同种类的水晶又会有相对不稳定的物理变色现象，只有满足这些条件水晶的色泽便会发生一定的变化，比如艳丽的水晶很容易发生变化。像托帕石会由黄变蓝、紫水晶会由紫变紫黄、黄色此类水晶俗称紫黄晶、黄水晶（并非所有紫黄晶、黄水晶均是紫水晶变色而来），粉水晶则颜色慢慢变淡，而黄水晶则可能会变深黄色等等，若想要此类水晶产生变色现象则需要在一定的温度下方能产生。而褪色则需要满足一下两种可能：
一是长时间的大幅度暴晒，由于水晶性脆，应该尽量避免高温暴晒，否则会使得其颜色发生变化或者褪色甚至爆裂；另一方面人为高温热处理，一般水晶加工中为了求得一种特定的颜色而利用高温仪器将天然水晶进行变色处理，这种工艺就是利用了水晶遇高温变色的特性。以上是在一定的技术条件下产生的，而在常温下出现天然水晶掉色或者褪色情况的，一般认为此类水晶为人造假水晶或者是天然水晶染色而成想要的水晶。应尽量避免天然水晶与一切高温接触，尽量减少其暴晒时间，长期佩戴以后需要进行消磁净化，以免发生化学变化！水晶的分子带有负极电离子，当人体配戴后，它的分子接受到人体体温的活化，会与人体产生交互作用，代谢了水晶颜色所对应轮位附近脏腑器官的病气。水晶的作用会把血液中的正离子给替换出来，当身体健康，情绪稳定，再加上水晶颜色光谱所产生频率共振吸引机会与缘份。但水晶使用过度它把好的能量(彩光)给佩戴者，它就会失去生命力，如果发现水晶脏脏温温或是退色就表示该消磁了。注意事项注意：应尽量避免天然水晶与一切高温接触，尽量减少其暴晒时间，长期佩戴以后需要进行消磁净化。
