单位代扣个人的工会经费记账的一般做法如下：
1. 在会计科目中设置一个专门的子科目，用于记录工会经费的收入和支出。
可以命名为“工会经费”或者“工会会费”。
2. 收入记账：当单位代扣个人工会经费时，应按照所代扣的金额记账。记账分录一般为：借记“工会经费”科目，贷记“应付工资”或“应付薪酬”科目（根据实际会计科目设置而定）。
3. 支出记账：当使用工会经费时，应按照支出的金额记账。记账分录一般为：借记相应的费用科目（比如“差旅费”、“培训费”等），贷记“工会经费”科目。
4. 定期汇总：根据需要，可以定期对工会经费进行汇总，以便了解该项经费的收入和支出情况，并进行相应的财务分析和报表编制。需要注意的是，具体的记账方式和科目设置可能因不同的企业或组织而有所不同，建议根据实际情况进行调整和规划。同时，也需要遵守相关法律法规和组织章程等规定，确保工会经费的合理使用和透明度。建议咨询专业会计师或财务人员，以确保记账的准确性和合规性。
