1、专项摇号的申请参与条件更苛刻由上文可知，专项摇号会在普通摇号申请条件的基础上，额外增加条件以达到专项定向的效果，比如申请人需要累计参与过60期普通摇号且未曾中签，即便居民每期都参与，想要累计达到60期，至少也需要花5年的时间。
2、专项摇号的中签率更高因为专项摇号往往都是面向特定人群，满足专项摇号参与条件的人并不多，而专项摇号投放的指标也并不少，所以整体的中签率就会高很多，像深圳专项摇号的中签率就为42.35%，高于平时0.226%的个人普通摇号中签率，天津市的专项摇号中签率则同样高达53.11%。
3、普通摇号举办频率更高且稳定专项摇号的举办时间往往都是不固定的，而且也是最近才推出的，一年可能也就只有一次，相反大部分城市的普通摇号则是每个月都会定时进行，一年最多有12次。
4、普通摇号所获得的指标适用范围更广专项摇号所获得的指标只能用于购买新车，不能买二手车，而且像深圳市的专项指标，对新车的价格还会有要求，燃油车售价要达到30万及以上，新能源车的售价则要达到10万及以上。
