事业单位编内编外人员的档案应该放在单位的人事档案室或者档案管理中心。
具体来说,编内人员的档案应该由单位的人事部门或者档案管理中心负责管理,包括个人基本信息、工作经历、考核评价、奖惩记录等内容。而编外人员的档案则应该由单位的劳务派遣部门或者合同管理部门负责管理,包括个人基本信息、劳动合同、工资福利、社保缴纳等内容。在管理档案时,应该注意以下几点:档案应该按照规定的分类和编号进行归档,确保档案的完整性和准确性。档案应该妥善保管,防止遗失、损毁或泄露。档案应该定期进行整理和清理,及时更新和补充档案内容。档案应该严格遵守相关法律法规和保密规定,确保个人隐私和机密信息不被泄露。需要注意的是,不同单位对于档案管理的具体要求可能会有所不同,建议您在入职时了解并遵守单位的相关规定。