九院现在主要使用的是三个校区，包括主校区、浔东校区、庐峰校区。
1、九江学院的主校区位于濂溪区前进东路551号主校区包括经济学院、法学院、文学与传媒学院、外国语学院等大部分学院。
2、九江学院浔东校区位于浔阳区浔阳东路320号浔阳区位于九江市南部，地处长江下游的平原地带，辖区面积为596平方公里。九江学院所在的地理位置交通便利，周围有许多商业街和市政公共设施，生活非常方便。包括有基础医学院、药学与生命科学学院、护理学院、继续教育学院4个二级学院。
3、九江学院庐峰校区位于浔阳区庐峰路17号目前设有临床医学院；5年制临床医学、临床医学（农村定向医学生）、临床医学（麻醉学方向）、4年制药学等专业。
