如果你的大学户口迁移时，学校丢失了相关的迁移文件，你可以按照以下步骤来处理：
1. 首先，与学校户口迁移相关的部门、教务处或学生事务办公室等联系，告知他们学校丢失了你的户口迁移文件。
2. 询问学校相关部门是否有备份文件或其他替代方案，可以用来证明你的户口迁移情况。有可能学校在电子系统或其他备份文件中保存有相关信息。
3. 如果学校没有备份文件或其他替代的证明方式，你可以向原户籍所在地的派出所、居民委员会或县/市区民政局联系，查询是否有相关迁移记录。他们可能会有你的迁移记录和文件备份。
4. 如果在原户籍地没有找到相关记录，你可以联系当地的公安局出入境管理部门，查询是否有你迁移时的相关文件备份。他们也许会有你迁移的相关记录。
5. 在没有找到任何相关备份文件的情况下，你需要咨询学校的户口管理部门或教务处，并向他们提供其他证明你就读该学校的材料，比如学校的入学通知书、学生证、成绩单等。这些文件可以证明你在学校就读的时间和身份。
6. 如果学校仍然无法提供相关证明，你可能需要咨询当地的公安户籍部门，了解如何补办或重新办理户口迁移手续。最重要的是与学校的有关部门进行沟通，并积极寻求他们的帮助和指导，以完成相应的手续和解决问题。
