iPhone6和iPhone6s的主要区别有处理器、运行内存、机身尺寸及重量、影像系统及机身配色等。
1、处理器iPhone6采用苹果 A8+M8协处理器；20nm制程工艺，双核心设计，CPU频率为1.4GHz；iPhone6s采用苹果A9+M9协处理器，14nm制程工艺，双核心设计，CPU频率为1.8GHz；A9的处理器性能要更好一些，A9的单核性能比A8大约提升了20%，多核性能则提升了70%左右，GPU的性能，则提升了约90%。
2、运行内存iPhone6的运行内存为1GB，iPhone6s的运行内存为2GB，运行内存越大，手机性能越好，可运行的程序越多，应用运行也越流畅。
3、机身尺寸及重量iPhone6的机身尺寸为138.1 毫米*67.0 毫米*6.9 毫米，重约129 克；iPhone6s的机身尺寸为138.3 毫米*67.1 毫米*7.1 毫米，重约143克；iPhone6s的尺寸更大，机身也更重。
4、影像系统iPhone6后置800 万像素单摄 (广角镜头)，最高可达 5 倍数码变焦，支持拍摄全高清视频；前置FaceTime 高清摄像头，可拍摄120 万像素照片和720P高清视频；iPhone6s 后置1200 万像素单摄 (广角)，最高可达 5 倍数码变焦，支持拍摄4K视频和全高清视频；前置FaceTime 高清摄像头，可拍摄500万像素照片和720P高清视频。影像系统方面，iPhone6s配置更高，性能更好一些。
5、机身颜色iPhone6的机身颜色有银色、深空灰色、金色三款；iPhone6s的机身颜色有银色、金色、玫瑰金色、深空灰色四款。其余配置大致相同。
