一、专业不同1、制药工程专业制药工程专业培养具有制药工程方面的知识，能在医药、农药、精细化工和生物化工等部门从事医药产品的合成与工艺研究、医药产品开发、应用研究和经营管理等方面的高素质研究应用型专门人才。
制药工程是一个化学、药学（中药学）和工程学交叉的工科类专业，以培养从事药品制造，新工艺、新设备、新品种的开发、放大和设计人才为目标。
2、生物制药专业生物制药技术作为一种高新技术，是70年代初伴随着DNA重组技术和淋巴细胞杂交瘤技术的发明和应用而诞生的。三十多年来，生物制药技术的飞速发展为医疗业、制药业的发展开辟了广阔的前景，极大地改善了人们的生活。
二、培养要求不同1、制药工程专业该专业学生主要学习有机化学、物理化学、化工原理、药物合成化学、制药工艺学、药物化学、药理学、药剂学、生物化学等方面的基本知识和基本理论，受到化学与化工实验技能、工程实践、计算机应用、科学研究与工程设计方法的基本训练，具有从事医药产品的开发与生产的基本能力。
2、生物制药专业该专业学生应掌握生物化学、生化分离分析技术、生物技术及工业药剂学等方面的基本理论知识和专业技能，受到生物制药研究和生产技术的基本训练，具有对药品的新资源、新产品、新工艺进行研究、开发和设计的初步能力。
三、毕业去向不同1、制药工程专业制药工程专业毕业后可到制药工程（或医药生物技术）领域相关的生产企业、营销企业、科研院所、药品监督管理部门等企、事业单位从事药品生产、管理、营销、检验监督和研发等工作。也适于报考生物技术、药学及相关专业的研究生。
2、生物制药专业从现今情况看从事生物医药产品研究与开发的人才严重不足，已成为制约我国生物医药产业发展的瓶颈，因此该专业的就业前景非常好，毕业生可从事生物药物的资源开发、产品研制、生产、技术管理、质量控制等工作。
2.相对来说还是制药工程好就业。生物工程这个专业本科毕业挺难就业，不读研甚至读博，发展前景是受限制的，而且要深造的话，最好是去欧美发达国家，那边的学术环境和研究条件都要好于国内。曾经生物热的时候，这个专业真是火遍全球，各大投行也非常看好生物方向的项目，但是很明显从近些年来的投资数据看，生物的研究项目投资额年年都在递减。制药工程专业毕业后可到制药工程（或医药生物技术）领域相关的生产企业、营销企业、科研院所、药品监督管理部门等企、事业单位从事药品生产、管理、营销、检验监督和研发等工作。也适于报考生物技术、药学及相关专业的研究生。扩展资料报考专业要考虑专业质量高等院校中与“药”有关的专业远不止制药工程一个，许多药学类专业、若干医学类专业、化工类专业、生物工程类专业、生物技术类专业、食品类专业、化学类专业、中药学专业等，它们的毕业生都能够参与制药企业的工作，是一股建设和发展中国制药行业的重要力量，当然也就成为与制药工程专业的毕业生竞争制药行业工作岗位的人才源。鉴于这样的背景，就必须要考虑制药工程专业的办学规模和办学质量，也就是说，在制定制药工程专业的培养计划和专业知识结构上，既要注重专业的质量和特色，办出具有针对性较强的专业，同时也要适当控制人才培养的数量，使其符合制药行业的发展趋势。这里所说的专业质量和特色是办好制药工程专业的核心问题。
